| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Atribacterota |
| Classe | Atribacteria |
| Ordre | Atribacterales |
| Famille | Atribacteraceae |
| Genre | Atribacter |
Atribacter laminatus est une espèce de bactéries de la famille des Atribacteraceae.
Historique
La souche type de cette espèce Atribacter laminatus a été isolée d'un mélange de sédiments et d'eau prélevés à partir de sédiments profonds d'un aquifère salin comprenant du gaz naturel au Japon[1].
Description
Ces bactéries sont des bacilles à gram négatif anaérobies stricts, ne formant pas de spores mais pouvant aussi avoir une forme plus ovoïde avec des extrémités plus pointues[1]. Leurs dimensions sont de 0,6 à 0,8 μm de large et de 1,3 à 1,8 μm de long[2]. Contrairement à la plupart des bactéries gram négatives, les cellules d'Atribacter laminatus possèdent trois bicouches lipidiques[1].
En culture, ces bactéries forment des colonies brun clair, circulaires et convexes. La croissance de ces bactéries est optimale à 45 °C, pH 7.3 et avec une salinité de 0,1 M mais elle peut se produire aussi dans des intervalles de 20 à 50 °C, pH de 6,4 à 8,2 et 0,01 M à 0,6 M[2]. La culture de cette bactérie nécessite la présence d'extrait de levure tandis que la peptone et les acides casaminés ne la stimulent pas[2]. Cette culture peut aussi être améliorée avec un méthanogène piégeur d'hydrogène[2].
La croissance est possible avec les sucres suivants : cellobiose, fructose, galactose, glucose, mannitol, mannose, pectine, raffinose, rhamnose, saccharose, sorbitol, xylose. La dégradation du glucose produit de l'acétate, de l'hydrogène et du dioxyde de carbone. Atribacter laminatus n'utilise pas les sucres suivants : amidon, arabinose, cellulose, gélatine, lactose, maltose, mélibiose, ribose, tréhalose[2].
Taxonomie
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Atribacter laminatus Katayama et al. 2021[3]. Sa souche type est le souche RT761 déposée dans des banques de cultures bactériennes sous les numéros NBRC112890 et DSM 105538[2].
Étymologie
L'étymologie de cette espèce est la suivante : la.mi.na.tus. L. fem. n. lamina, couche; N.L. masc. adj. laminatus, en couches, appartenant à une membrane cellulaire multicouches[3].
Antibiorésistance
Atribacter laminatus est sensible au chloramphénicol, à la kanamycine, la rifampicine et la vancomycine, mais résistante à l'ampicilline. Katayama classe cette bactérie comme à la fois résistante et sensible à la néomycine[2].
Références
Bibliographie
- Publication originale (en) Taiki Katayama, Masaru K. Nobu, Hiroyuki Kusada, Xian-Ying Meng, Naoki Hosogi, Katsuyuki Uematsu, Hideyoshi Yoshioka, Yoichi Kamagata et Hideyuki Tamaki, « Isolation of a member of the candidate phylum ‘Atribacteria’ reveals a unique cell membrane structure », Nature Communications, vol. 11, no 1, , p. 6831 (lire en ligne)
- (en) Aharon Oren et George M. Garrity, « Validation list no. 199. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 71, no 5, , p. 4773 (DOI 10.1099/ijsem.0.004773)
Liens externes
- (fr + en) GBIF : Atribacter laminatus (consulté le )
- (en) LPSN : Atribacter laminatus Katayama et al. 2021 (consulté le )
