La saison 2016 du championnat de Lituanie de football est la 27e édition de la première division lituanienne. Les huit meilleurs clubs du pays sont regroupés en une poule unique où chaque équipe rencontre quatre fois ses adversaires. En fin de saison, le dernier du classement est relégué et remplacé par le meilleur club de deuxième division. Les six premiers s'affrontent une nouvelle fois pour le titre de champion.
C'est le FK Žalgiris Vilnius, tenant du titre, qui est à nouveau sacré cette saison, après avoir terminé en tête du classement final, avec neuf points d'avance sur le FK Trakai et dix-huit sur le FK Sūduva Marijampolė. Il s'agit du septième titre de champion de Lituanie de l'histoire du club, qui réalise même le doublé en s'imposant en finale de la Coupe de Lituanie.
L'avant-dernier de A-Lyga rencontre le vice-champion de 1.Lyga en matchs aller et retour pour déterminer le dernier club engagé en championnat lors de la saison suivante.