Cette page d’homonymie répertorie les différents comtés portant le même nom.
Trois comtés des États-Unis portent le nom de comté de Winnebago (Winnebago County) :
- le comté de Winnebago, situé dans l'État de l'Illinois ;
- le comté de Winnebago, situé dans l'État de l'Iowa ;
- le comté de Winnebago, situé dans l'État du Wisconsin.