Lance Armstrong s'est vu retirer après sa retraite sportive le bénéfice des résultats obtenus à partir du mois d'août 1998, en raison de plusieurs infractions à la réglementation antidopage[n 1], révélées par l'Agence américaine antidopage (USADA). Sa huitième place et sa victoire d'étape lui sont donc retirées.
Attaquant infatigable, Alexandre Vinokourov remporte cette course en parvenant à devancer Jonathan Vaughters, vainqueur au Mont Ventoux, dans l'avant-dernière étape. Les coureurs français se montrent à leur avantage en trustant les victoires d'étapes.
Le prologue s'est déroulé le dans les rues d'Autun.
Le revenant Lance Armstrong s'impose tandis que Chris Boardman, favori annoncé et vainqueur des cinq derniers prologues du Critérium du Dauphiné, ne termine qu'à la 17e place.
La première étape s'est déroulée le entre Autun et La Tour-de-Salvagny.
Elle voit la première victoire professionnelle du "régional de l'étape", Christophe Oriol, qui s'impose en solitaire après un démarrage opportun à 4 km de l'arrivée. Lance Armstrong conserve le maillot jaune et bleu de leader.
Porteur du maillot vert, le jeune Kazakh Alexandre Vinokourov remporte cette étape en solitaire et s'empare du maillot de leader. Il a devancé ses compagnons d'échappée dans les derniers kilomètres. Le peloton où figurait Lance Armstrong termine avec un retard conséquent de 3 minutes et 39 secondes.
Victoire inattendue de l'Américain Jonathan Vaughters dans cette ascension contre-la-montre du Mont Ventoux. Il s'empare du maillot de leader devant Alexandre Vinokourov, 2e au général à seulement 7 secondes. La victoire finale se jouera entre ces deux coureurs, tous les autres étant relégués à plus de 4 minutes.
Laurent Madouas s'impose au sprint devant Lylian Lebreton. Les deux coureurs ont parcouru quasiment toute l'étape en tête, s'échappant dès le troisième kilomètre. Jonathan Vaughters conserve le maillot de leader.