Cet article présente une liste de musées protestants par localisation.

• Stellenbosch : Hugenote-Gedenkmuseum & Hugenotenmonument (musée et monument aux Huguenots)

• Bretten : Maison Melanchthon (en)

• Emden : Bibliothèque Jean de Lasco, dans la grande église, dite Moederkerk, restaurée à cet effet.

• Berlin : musée huguenot de Berlin (dans le Temple français de la Friedrichstadt, « cathédrale française » de Berlin)

• Bad Karlshafen : musée huguenot allemand (au sein de la maison allemande des huguenots - Deutsches Hugenotten-Zentrum)[1]

• Leipzig : Bach-Archiv

• Wittemberg : Maison de Luther
• Wittemberg : Maison Melanchthon (en)

• Eisenach : Maison natale de Jean-Sébastien Bach
• Eisenach : château de la Wartbourg

• Bruxelles : jardin du Petit Sablon (Fontaine des comtes d'Egmont et de Hornes, statues de Guillaume d'Orange, Philippe de Marnix...)

• Horebeke : Protestants Historisch Museum Abraham Hans (musée historique protestant Abraham Hans)
• Vilvorde : monument commémoratif et musée William Tyndale^[1].

• Le Poët-Laval (Drôme) : musée du protestantisme dauphinois
• Pranles (Ardèche) : musée du Vivarais protestant

• Châtillon-Coligny (Loiret) : musée Châtillon-Coligny

• Gunsbach (Haut-Rhin) : musée Albert-Schweitzer
• Kaysersberg (Haut-Rhin) : musée Albert-Schweitzer
• Waldersbach (Bas-Rhin) : musée Jean-Frédéric-Oberlin
• Wassy (Haute-Marne) : musée protestant de la grange de Wassy

• Lemé (Aisne) : temple de Lemé

• Paris (Seine) : monument de l'amiral de Coligny, au 160, rue de Rivoli ou 1, rue de l'Oratoire

• Arvert (Charente-Maritime) : maison de l'histoire du protestantisme charentais
• Beaussais (Deux-Sèvres) : maison du protestantisme
• La Couarde (Deux-Sèvres) : maison du protestantisme poitevin
• La Rochelle (Charente-Maritime) : musée rochelais d’histoire protestante
• Orthez (Pyrénées-Atlantiques) : musée Jeanne d'Albret

• Aigues-Mortes (Gard) : Tour de Constance
• Carla-Bayle (Ariège) : Maison Pierre Bayle
• Ferrières (Tarn) : Musée du protestantisme
• Mialet (Gard) : Musée du Désert
• Nîmes (Gard) : Maison du protestantisme
• Saint-Jean-du-Gard (Gard) : Musée des vallées cévenoles

• Monsireigne (Vendée) : Musée de la France protestante de l'Ouest

• Île Sainte-Marguerite, Cannes (Bouches-du-Rhône) : Mémorial Huguenot de l’Ile Sainte Marguerite (Musée de la Mer de Cannes)

• Torre Pellice : musée vaudois (museo valdese)

• Utrecht : Musée du couvent Sainte-Catherine (contient des objets d'art religieux tant catholiques que protestants)

• Londres : Musée du méthodisme, hébergé dans la Chapelle Wesley
• Rochester : Musée huguenot, hébergé dans l'Hôpital français (La Providence) Musée huguenot

• Édimbourg : Maison de John Knox

• Genève : Musée international de la Réforme

• Zurich : Musée national suisse (dont l'exposition historique permanente montre beaucoup d'éléments sur la Réforme et la Contre-Réforme et décrit le rôle de Jean Calvin dans la formation de la culture suisse.)

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