- En ostéologie la protubérance est une saillie sur un os (comme le petit ou le grand trochanter sur le fémur) ou sur une autre structure externe.
- En neuroanatomie, la protubérance annulaire (ou Pont de Varole) fait partie du tronc cérébral, elle est située au-dessus du bulbe rachidien et au-dessous des pédoncules cérébraux :
- En astronomie, une protubérance est un immense jet de gaz ionisé expulsé du Soleil ;
- En météorologie, le sommet protubérant est un dépassement en forme de dôme au sommet d'un cumulonimbus lorsque le courant ascendant dans le nuage est particulièrement fort.