Le Superprestige 2006-2007 est la 25e édition du Superprestige, compétition qui se déroule entre le et le et composée de huit manches pour les élites hommes, espoirs et juniors ayant lieu en Belgique et aux Pays-Bas. Toutes les épreuves font partie du calendrier de la saison de cyclo-cross masculine 2006-2007. Les classements sont remportés par le Belge Sven Nys pour la septième fois chez les élites, par son compatriote Niels Albert pour la troisième fois chez les espoirs et par le Néerlandais Ramon Sinkeldam chez les juniors.
Les 15 premiers de chaque course marquent des points pour le classement général. Pour les cyclo-cross d'Asper-Gavere et de Diegem, les points sont doublés.