Virus de la forêt de Kyasanur

Classification
Domaine	Riboviria
Règne	Orthornavirae
Embranchement	Kitrinoviricota
Classe	Flasuviricetes
Ordre	Amarillovirales
Famille	Flaviviridae
Genre	Orthoflavivirus

Orthoflavivirus kyasanurense

Orthoflavivirus kyasanurense, ou virus de la forêt de Kyasanur (en anglais : Kyasanur Forest disease virus, KFDV), est une espèce d'arbovirus de la famille des Flaviviridae et du genre Orthoflavivirus. Ce sont des virus à ARN monocaténaire à polarité positive^[2], ayant pour vecteur des tiques. Le virus KFDV fait partie des flavivirus pathogènes pour l'humain et provoque une fièvre hémorragique^[3].

L'espèce regroupe :

la souche responsable de la maladie de la forêt de Kyasanur ;
une autre souche, le virus d'Alkhurma (ALKV), différente mais dont 89 % des séquences nucléotidiques sont homologues à celle de Kyasanur^[4].

Les deux souches auraient divergé il y a 700 ans^[5].

Les espèces du virus de la fièvre hémorragique d'Omsk et du virus de la ferme royale sont apparentées.

Souche indienne

Le virus a été isolé pour la première fois en Inde en 1957. Il a comme vecteur la tique Haemaphysalis spinigera (en) tandis que l'animal hôte est le singe (il y a été isolé chez Semnopithecus entellus)^[3]. Il est à l'origine d'épidémies régionales circonscrites^[6].

Souche arabe

Le virus d'Alkhurma appartient à cette espèce. Il est nommé d'après Al Khurmah (ar), (une localité d'Arabie saoudite) où le premier cas porteur de la souche-type ALKV 1776 a été identifié dans les années 1990. Il est notamment transmis par la tique Ornithodoros savignyi (en)^[7]. Il peut infecter humains, moutons ou dromadaires.

Après une période d'incubation variable (de deux à huit jours), les personnes atteintes développent des symptômes tels que fièvre, maux de tête, douleurs articulaires, douleurs musculaires, vomissements, perte d'appétit, grand inconfort et frissons. Moins de 10 % des personnes développent des symptômes neurologiques affectant le système nerveux central et hémorragiques graves, tels que purpura, hallucinations, désorientation, convulsions et épistaxis potentiellement mortelles^[8]^,^[9]. Des enzymes hépatiques élevées, une leucopénie, une protéinurie et une thrombopénie, entrainant une fièvre hémorragique et une encéphalite (potentiellement mortelles), ont été observées chez des patients hospitalisés^[10]^,^[11]^,^[9].

Le mode de transmission de l'ALKV n'est pas clair. Plusieurs voies de transmission sont suspectées :

des morsures par une tique infectée ;
écrasement d'une tique infectée avec des doigts non protégés ;
ingestion de lait de chamelle non pasteurisé ;
contamination d'une plaie^[12].

Aucun cas de transmission interhumaine n'a été relevé^[13].

Description

Le virus contient plus de 10 000 nucléotides, avec un seul ORF, codant des polyprotéines de plus de 3 000 acides aminés. Les protéines AnhC, PrM, M, NS2A, NS2B, NS3, NS4A, 2K, NS4B et NS5 ont toutes la même longueur. Ce virus possède la plus grande polyprotéine de tous les flavivirus TB étudiés^[14].

Il n'existe pas de traitement spécifique. La prévention reste le principal moyen de lutter contre ces infections.

Notes et références

↑ (en) « Virus Taxonomy: 2023 Release », ICTV, août 2024 (consulté le 19 août 2024).
↑ Claude M. Fauquet, M.A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger and L.A. Ball, Virus Taxonomy: VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Academic Press, 15 luglio 2005 (ISBN 978-0-08-057548-3, lire en ligne), p. 1257–
↑ ^{a et b} (en) E A Gould et Tom Solomon, « Pathogenic flaviviruses », The Lancet, Elsevier, vol. 371, n^o 9611,‎ 1^er février 2008, p. 500-509 (ISSN 0140-6736 et 1474-547X, OCLC 01755507, PMID 18262042, DOI 10.1016/S0140-6736(08)60238-X).
↑ DOI 10.1086/656326
↑ KA Dodd, BH Bird, ML Khristova, CG Albariño, SA Carroll, JA Comer, BR Erickson, PE Rollin et ST Nichol, « Ancient ancestry of KFDV and AHFV revealed by complete genome analyses of viruses isolated from ticks and mammalian hosts », PLOS Negl Trop Dis, vol. 5, n^o 10,‎ 2011, e1352 (PMID 21991403, PMCID 3186760, DOI 10.1371/journal.pntd.0001352)
↑ (en) Solomon T et Mallewa M, « Dengue and other emerging flaviviruses », Journal of Infection, Elsevier, vol. 42, n^o 2,‎ 1^er février 2001, p. 104-115 (ISSN 0163-4453 et 1532-2742, OCLC 04392967, PMID 11531316, DOI 10.1053/JINF.2001.0802).
↑ (en) Rémi N Charrel, Shamsudeen Fagbo, Gregory Moureau, Mohammad Hussain Alqahtani, Sarah Temmam et Xavier de Lamballerie, « Alkhurma hemorrhagic fever virus in Ornithodoros savignyi ticks », Emerging Infectious Diseases, CDC, vol. 13, n^o 1,‎ janvier 2007, p. 153-5 (ISSN 1080-6040 et 1080-6059, OCLC 31848353, PMID 17370534, PMCID 2725816, DOI 10.3201/EID1301.061094).
↑ Ernest Tambo et Ashraf El-Dessouky, « Defeating re-emerging Alkhurma hemorrhagic fever virus outbreak in Saudi Arabia and worldwide », PLOS Negl Trop Dis, vol. 12, n^o 9,‎ 27 septembre 2018, e0006707 (PMID 30260960, PMCID 6159858, DOI 10.1371/journal.pntd.0006707)
↑ ^{a et b} « Alkhurma Virus (AHFV) », sur Gesundes Reisen (German), MD Medicus Reise- und Tropenmedizin GmbH (consulté le 20 janvier 2019)
↑ Zaki AM, « Isolation of a flavivirus related to the tick-borne encephalitis complex from human cases in Saudi Arabia », Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg., vol. 91, n^o 2,‎ 1997, p. 179–81 (PMID 9196762, DOI 10.1016/S0035-9203(97)90215-7)
↑ « Alkhurma Hemorrhagic Fever (AHF) », sur Centers for Disease Control and Prevention, U.S. Department of Health & Human Services (consulté le 16 janvier 2019)
↑ « Alkhurma Hemorrhagic Fever », sur MalaCards, Weizmann Institute of Science (consulté le 16 janvier 2019)
↑ « Alkhurma Hemorrhagic Fever (AHF) - Transmission », sur Centers for Disease Control and Prevention, U.S. Government (consulté le 16 janvier 2019)
↑ Rémi Charrel, Ali Zaki, Houssam Attoui, Mazen Fakeeh, Frédérique Billoir, Amany Yousef, Reine Chesse, Philippe Micco, Ernest Gould et Xavier Lamballerie, « Complete Coding Sequence of the Alkhurma Virus, a Tick-Borne Flavivirus Causing Severe Hemorrhagic Fever in Humans in Saudi Arabia », Biochemical and Biophysical Research Communications, vol. 287, n^o 2,‎ 17 août 2001, p. 455–461 (PMID 11554750, DOI 10.1006/bbrc.2001.5610, lire en ligne, consulté le 20 janvier 2019)

Articles connexes

Liens externes

Ressource relative au vivant :
- Interim Register of Marine and Nonmarine Genera

[ICTV-1] (en) « Virus Taxonomy: 2023 Release », ICTV, août 2024 (consulté le 19 août 2024).

[FauquetMayo2005-2] Claude M. Fauquet, M.A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger and L.A. Ball, Virus Taxonomy: VIIIth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Academic Press, 15 luglio 2005 (ISBN 978-0-08-057548-3, lire en ligne), p. 1257–

[pmid18262042-3] {a et b} (en) E A Gould et Tom Solomon, « Pathogenic flaviviruses », The Lancet, Elsevier, vol. 371, n^o 9611,‎ 1^er février 2008, p. 500-509 (ISSN 0140-6736 et 1474-547X, OCLC 01755507, PMID 18262042, DOI 10.1016/S0140-6736(08)60238-X).

[4] DOI 10.1086/656326

[Dodd2011-5] KA Dodd, BH Bird, ML Khristova, CG Albariño, SA Carroll, JA Comer, BR Erickson, PE Rollin et ST Nichol, « Ancient ancestry of KFDV and AHFV revealed by complete genome analyses of viruses isolated from ticks and mammalian hosts », PLOS Negl Trop Dis, vol. 5, n^o 10,‎ 2011, e1352 (PMID 21991403, PMCID 3186760, DOI 10.1371/journal.pntd.0001352)

[pmid11531316-6] (en) Solomon T et Mallewa M, « Dengue and other emerging flaviviruses », Journal of Infection, Elsevier, vol. 42, n^o 2,‎ 1^er février 2001, p. 104-115 (ISSN 0163-4453 et 1532-2742, OCLC 04392967, PMID 11531316, DOI 10.1053/JINF.2001.0802).

[7] (en) Rémi N Charrel, Shamsudeen Fagbo, Gregory Moureau, Mohammad Hussain Alqahtani, Sarah Temmam et Xavier de Lamballerie, « Alkhurma hemorrhagic fever virus in Ornithodoros savignyi ticks », Emerging Infectious Diseases, CDC, vol. 13, n^o 1,‎ janvier 2007, p. 153-5 (ISSN 1080-6040 et 1080-6059, OCLC 31848353, PMID 17370534, PMCID 2725816, DOI 10.3201/EID1301.061094).

[PMC18J1-8] Ernest Tambo et Ashraf El-Dessouky, « Defeating re-emerging Alkhurma hemorrhagic fever virus outbreak in Saudi Arabia and worldwide », PLOS Negl Trop Dis, vol. 12, n^o 9,‎ 27 septembre 2018, e0006707 (PMID 30260960, PMCID 6159858, DOI 10.1371/journal.pntd.0006707)

[GR-9] {a et b} « Alkhurma Virus (AHFV) », sur Gesundes Reisen (German), MD Medicus Reise- und Tropenmedizin GmbH (consulté le 20 janvier 2019)

[10] Zaki AM, « Isolation of a flavivirus related to the tick-borne encephalitis complex from human cases in Saudi Arabia », Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg., vol. 91, n^o 2,‎ 1997, p. 179–81 (PMID 9196762, DOI 10.1016/S0035-9203(97)90215-7)

[11] « Alkhurma Hemorrhagic Fever (AHF) », sur Centers for Disease Control and Prevention, U.S. Department of Health & Human Services (consulté le 16 janvier 2019)

[12] « Alkhurma Hemorrhagic Fever », sur MalaCards, Weizmann Institute of Science (consulté le 16 janvier 2019)

[13] « Alkhurma Hemorrhagic Fever (AHF) - Transmission », sur Centers for Disease Control and Prevention, U.S. Government (consulté le 16 janvier 2019)

[SAJ1-14] Rémi Charrel, Ali Zaki, Houssam Attoui, Mazen Fakeeh, Frédérique Billoir, Amany Yousef, Reine Chesse, Philippe Micco, Ernest Gould et Xavier Lamballerie, « Complete Coding Sequence of the Alkhurma Virus, a Tick-Borne Flavivirus Causing Severe Hemorrhagic Fever in Humans in Saudi Arabia », Biochemical and Biophysical Research Communications, vol. 287, n^o 2,‎ 17 août 2001, p. 455–461 (PMID 11554750, DOI 10.1006/bbrc.2001.5610, lire en ligne, consulté le 20 janvier 2019)

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v · m Flaviviridae
Hepacivirus	bovis colobi equi (en) glareoli hominis macronycteridis myodae norvegici otomopis peromysci platyrrhini ratti rhabdomysis vittatae
Orthoflavivirus	apoiense aroaense bagazaense banziense boubouiense bravoense bukalasaense cacipacoreense careyense cowboneense dakarense denguei edgehillense encephalitidis entebbeense (en) flavi gadgetsense (en) ilheusense israelense japonicum jugraense jutiapaense kadamense (en) kedougouense (en) kokoberaorum koutangoense kyasanurense langatense (en) louisense loupingi meabanense modocense (en) montanaense murrayense nilense ntayaense omskense perlitaense phnompenhense powassanense (en) royalense saboyaense saumarezense sepikense (en) tembusu tyuleniyense ugandaense usutuense viejaense wesselsbronense (en) yaoundeense yokoseense (en) zikaense
Pegivirus	caballi (en) carolliae columbiaense equi hominis neotomae platyrrhini pteropi scotophili sturnirae suis
Pestivirus	antilocaprae australiaense aydinense bovis brazilense giraffae L M N O ovis P Q R ratti S scrofae suis tauri