Haplogroupe CT

Caractéristiques
Date d'origine	100 000 années avant Jésus-Christ
Place d'origine	Afrique de l'Est
Ancêtre	BT
Descendants	CF et DE
Mutations définies	P9.1, M168, M294, V9, V41, V54, V189, et V226

En génétique humaine, l'haplogroupe CT est un haplogroupe du chromosome Y, définissant une des lignées ancestrales majeures communes à l'humanité le long des lignées mâles de père en fils.

Les hommes dans cet haplogroupe ont un chromosome Y avec la mutation SNP M168, accompagnée des mutations P9.1 et M294. Ces mutations sont présentes dans toutes les lignées mâles humaines excepté les A et B, qui sont tous deux presque exclusivement africains.

Généralités

Le plus récent ancêtre patrilinéaire commun (en anglais MRCA ou Most Recent Common Ancestor) de tous les hommes CT d'aujourd'hui est probablement plus ancien que la première migration de Homo sapiens hors d'Afrique (Out of Africa), migration à laquelle quelques-uns de ses descendants participèrent. Il aurait vécu en Afrique avant cette migration fortement supposée^[3]^,^[2]^,^[4].

En conservant le concept de l'Adam Y-chromosomal (plus récent ancêtre patrilinéaire commun de tous les hommes vivants), CT-M168 est popularisé dans des articles comme le lignage de l'Adam Eurasien (plus récent ancêtre patrilinéaire commun à tous les non-Africains).

Aucun individu masculin n'a encore été découvert dans le paragroupe CT*, ce qui signifie que tous les hommes dans cet haplogroupe sont aussi définis comme étant dans une de ses branches majeures, les sous-clades. Tous les lignages connus survivants qui descendent de CT sont dans un des deux sous-clades majeurs, l'haplogroupe CF et l'haplogroupe DE. Tous les deux semblent être apparus seulement quelques milliers d'années après le premier ancêtre commun de CT. À son tour, DE est divisé en un haplogroupe D très majoritairement asiatique (et marginalement africain^[5]) et un haplogroupe E distribué surtout en Afrique, tandis que CF est divisé en un haplogroupe C est-asiatique, nord-américain (marginalement sud-américain^[6]) et océanien et un haplogroupe F, qui est dominant dans la plupart des populations non-africaines^[3].

L'haplogroupe CT est donc le lignage ancêtre commun à beaucoup d'hommes vivants aujourd'hui, incluant la plupart des Africains parmi lesquels l'haplogroupe E prédomine, et beaucoup de non-Africains, parmi lesquels l'haplogroupe F prédomine.

Sous-clades

Haplogroupe CF (P143)
- Haplogroupe C (Y-ADN) (M130, M216) : en Asie, Océanie, et Amérique du Nord
  - Haplogroupe C1 (F3393)
    - Haplogroupe C1a (CTS11043)
      - Haplogroupe C1a1 (M8, M105, M131) : au Japon
      - Haplogroupe C1a2 (V20) : en Europe
    - Haplogroupe C1b (F1370)
      - Haplogroupe C1b (K281)
        Haplogroupe C1b1a (B66/Z16458)
        Haplogroupe C1b1a1, anciennement C5 (M356) : en Asie du Sud, Asie centrale, et Asie du Sud-Ouest
      - Haplogroupe C1b2 (B477/Z31885)
        Haplogroupe C1b2a, anciennement C2 (M38) : en Indonésie, Nouvelle-Guinée, Mélanésie, Micronésie, et Polynésie
        
        Haplogroupe C1b2b, anciennement C4 (M347) : chez les Aborigènes d'Australie
  - Haplogroupe C2, anciennement C3 (M217, P44) : à travers l'Eurasie et l'Amérique du Nord, mais surtout parmi les Mongols, Kazakhs, Tongouses, Paléo-sibériens et en Amérique du Nord, les peuples de langues na-dené
- Haplogroupe F (Y-ADN) (M89, M213) : à travers l'Eurasie, l'Océanie, et Les Amériques
  - F1 (P91, P104)
  - F2 (M427, M428)
  - F3 (P96)
  - F4 (P254)
  - Haplogroupe G (Y-ADN) (M201, P257) : en Europe, Asie de l'Ouest, Asie centrale, Asie du Sud, et Afrique du Nord
  - Haplogroupe H (Y-ADN) (M69, M370) : en Asie du Sud, Asie centrale, Asie du Sud-Ouest
  - Haplogroupe IJK (Y-ADN) (L15/S137, L16/S138) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
    - Haplogroupe IJ (Y-ADN) (M429/P125) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
      - Haplogroupe I (Y-ADN) (M170, M258, P19, P38, P212, U179) : en Europe
      - Haplogroupe J (Y-ADN) (12f2.1, M304) : en Europe, Asie de l'Ouest, Afrique du Nord et Afrique de l'Est
    - Haplogroupe K (Y-ADN) (M9) : partout en Eurasie, Afrique du Nord, Océanie, Afrique de l'Est, et les Amériques
      - Haplogroupe LT (Y-ADN) (L298/P326)
        Haplogroupe L (Y-ADN) (M11, M20, M22, M61, M185, M295) : sur le sous-continent indien
        
        Haplogroupe T (Y-ADN) (M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272 (anciennement K2)) :en Asie du Sud-Ouest, Asie du Sud, est et sud de l'Inde, Afrique du Nord (Égypte, Tunisie, Maroc), la Corne de l'Afrique (Somalie, Éthiopie), Cameroun (les Peuls), Europe du Sud (Péninsule Ibérique, Italie, Grèce et leurs iles)
      - Haplogroupe K(xLT) (M526)
        Haplogroupe M (Y-ADN) (P256) : dans l'est de l'Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée et Mélanésie
        
        Haplogroupe NO (Y-ADN) (M214)
        Haplogroupe N (Y-ADN) (M231) : en Europe de l'Est, Asie du Nord et Asie de l'Est
        
        Haplogroupe O (Y-ADN) (M175) : en Océanie et Asie de l'Est
        
        Haplogroupe P (Y-ADN) (92R7, M45, M74/N12, P27.1/P207)
        Haplogroupe Q (Y-ADN) (M242) : dans les Amériques et l'Eurasie
        
        Haplogroupe R (Y-ADN) (M207/UTY2, M306/S1) : dans toute l'Eurasie et dans des parties de l'Afrique
        
        Haplogroupe S (YADN) (M230,P202, P204 (anciennement K5)) : dans l'est de l'Indonésie, en Papouasie-Nouvelle-Guinée et Mélanésie
Haplogroupe DE (Y-ADN) (M1/YAP, M145/P205, M203/Page36, P144, P153, P165, P167, P183)
- Haplogroupe D (Y-ADN) (M174) : au Tibet, Japon et aux iles Andaman
  - Haplogroupe D1 (M15)
  - Haplogroupe D2 (M55, M57, M64.1, M179, P37.1, P41.1 (M359.1), 12f2.2)
  - Haplogroupe D3 (P99)
- Haplogroupe E (M40, M96) : en Afrique et régions voisines
  - Haplogroupe E1 (P147)
    - Haplogroupe E1a (anciennement E1) (M33, M132)
    - Haplogroupe E1b (P177)
      - Haplogroupe E1b1 (anciennement E3) (P2, DYS391p)
        Haplogroupe E1b1a (anciennement E3a) (M2) : en Afrique de l'Ouest, Centrale, de l'Est et du Sud
        
        Haplogroupe E1b1b (anciennement E3b) (M215) : en Afrique de l'Est (Éthiopiens, Somalis), Afrique du Nord (Berbères, Touaregs^[7]), Moyen-Orient, Europe (surtout régions autour de la Mer Mediterranée)
  - Haplogroupe E2 (M75)

Références

↑ Kamin M, Saag L, Vincente M, et al., « A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture », Genome Research, vol. 25, n^o 4,‎ avril 2015, p. 459–466 (PMID 25770088, PMCID 4381518, DOI 10.1101/gr.186684.114)
↑ ^{a et b} (en) Linda Stone, Genes, Culture, and Human Evolution, Malden, Blackwell, 2007, 314 p., relié (ISBN 978-1-4051-5089-7, lire en ligne), « Voyages, Prehistoric Human Expansions », p. 187
↑ ^{a et b} T.M. Karafet, F.L. Mendez, M.B. Meilerman, P.A. Underhill, S.L. Zegura et M.F. Hammer, « New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree », Genome Research, vol. 18, n^o 5,‎ 2008, p. 830–8 (PMID 18385274, PMCID 2336805, DOI 10.1101/gr.7172008, lire en ligne)
↑ Underhill and Kivisild et T Kivisild, « Use of Y Chromosome and Mitochondrial DNA Population Structure in Tracing Human Migrations », Annu. Rev. Genet., vol. 41, n^o 1,‎ 2007, p. 539–64 (PMID 18076332, DOI 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407)
↑ (en) M. Haber, A.L. Jones, B.A. Connel, Asan, E. Arciero, Y. Huanming, M.G. Thomas, Y. Xue et C. Tyler-Smith, « « A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa » », Genetics,‎ juin 2019 (lire en ligne)
↑ (en) Massimo Mezzavilla, Maria Geppert, Chris Tyler-Smith, Lutz Roewer, Yali Xue, « Insights into the origin of rare haplogroup C3* Y chromosomes in South America from high-density autosomal SNP genotyping », Forensic Science International: Genetics,‎ 2015
↑ Pereira et al. (2010), Linking the sub-Saharan and West Eurasian gene pools: maternal and paternal heritage of the Tuareg nomads from the African Sahel, European Journal of Human Genetics (2010) 18, 915–923; doi:10.1038/ejhg.2010.21

Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN)

Plus récent ancêtre patrilinéaire commun

A

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

G

H

IJK

IJ

K

I

J

LT

K2

I1

L

T

MS

P

NO

M

S

Q

R

N

O

R1

R2

R1a

R1b

Portail de la biologie

[1] Kamin M, Saag L, Vincente M, et al., « A recent bottleneck of Y chromosome diversity coincides with a global change in culture », Genome Research, vol. 25, n^o 4,‎ avril 2015, p. 459–466 (PMID 25770088, PMCID 4381518, DOI 10.1101/gr.186684.114)

[stone-2] {a et b} (en) Linda Stone, Genes, Culture, and Human Evolution, Malden, Blackwell, 2007, 314 p., relié (ISBN 978-1-4051-5089-7, lire en ligne), « Voyages, Prehistoric Human Expansions », p. 187

[Karafet-3] {a et b} T.M. Karafet, F.L. Mendez, M.B. Meilerman, P.A. Underhill, S.L. Zegura et M.F. Hammer, « New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y chromosomal haplogroup tree », Genome Research, vol. 18, n^o 5,‎ 2008, p. 830–8 (PMID 18385274, PMCID 2336805, DOI 10.1101/gr.7172008, lire en ligne)

[UnderhillandKivisild-4] Underhill and Kivisild et T Kivisild, « Use of Y Chromosome and Mitochondrial DNA Population Structure in Tracing Human Migrations », Annu. Rev. Genet., vol. 41, n^o 1,‎ 2007, p. 539–64 (PMID 18076332, DOI 10.1146/annurev.genet.41.110306.130407)

[5] (en) M. Haber, A.L. Jones, B.A. Connel, Asan, E. Arciero, Y. Huanming, M.G. Thomas, Y. Xue et C. Tyler-Smith, « « A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa » », Genetics,‎ juin 2019 (lire en ligne)

[6] (en) Massimo Mezzavilla, Maria Geppert, Chris Tyler-Smith, Lutz Roewer, Yali Xue, « Insights into the origin of rare haplogroup C3* Y chromosomes in South America from high-density autosomal SNP genotyping », Forensic Science International: Genetics,‎ 2015

[Pereira2010-7] Pereira et al. (2010), Linking the sub-Saharan and West Eurasian gene pools: maternal and paternal heritage of the Tuareg nomads from the African Sahel, European Journal of Human Genetics (2010) 18, 915–923; doi:10.1038/ejhg.2010.21

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

Date d'origine	100 000 années avant Jésus-Christ^[1]
Place d'origine	Afrique de l'Est^[2]
Ancêtre	BT
Descendants	CF et DE
Mutations définies	P9.1, M168, M294, V9, V41, V54, V189, et V226